Согласно законопроекту, единый регулятор финрынков реализует свои полномочия независимо от правительства. Это также противоречит Конституции, согласно которой независимо от органов государственной власти РФ действуют только Центробанк, суды и прокуратура РФ, подчеркивает правительство.
Предлагаемая законопроектом структура регулятора представляет собой весьма сложную схему, говорится в заключении. Так, она включает в себя дирекцию, исполнительного директора, центральный исполнительный аппарат, внутреннего аудитора, исполнительные аппараты территориальных органов, а также три коллегии – уполномоченных наблюдателей, профессиональных сообществ и потребителей финансовых услуг. Эффективность управления такой структурой вызывает у правительства большие сомнения.
Кроме того, значительная часть органов единого регулятора формируется из представителей профессионального сообщества – «то есть тех, в отношении кого регулятор осуществляет регулятивную и надзорную деятельность». В связи с этим, считает правительство, «возникновение соответствующего конфликта интересов неизбежно».
Правительство подвергло критике и предусмотренное законопроектом финансирование регулятора за счет обязательных ежегодных целевых взносов участников рынка. Подобные взносы обладают признаками налогов и сборов и должны регулироваться налоговым законодательством, говорится в заключении. Определение размера взноса самим регулятором противоречит основам налогового законодательства, дает «неограниченные возможности для злоупотреблений» и затрудняет финансовое планирование деятельности для участников рынка, заявляет правительство.