Экипаж и находившиеся на судне курсанты сумели убрать поврежденные паруса и подкрепить оборванные и ослабленные снасти. Судно проследовало в порт Чарльстон для демонтажа надломленной части фок-мачты и далее продолжило участие в четвертом этапе регаты. Аварийный ремонт был произведен в период с сентября по ноябрь 2009 г. в Калининграде. Для расследования обстоятельств и причин аварийного случая, а также для проведения тендера по выбору судоремонтного предприятия страховщик привлекал сюрвейерскую компанию «Маринекс-АйТиЭс».
Корпус, машины, механизмы и оборудование четырехмачтового учебно-парусного судна «Крузенштерн» застрахованы в ОАО «АльфаСтрахование» от полной гибели и повреждений.
Участие в регате Tall Ships Atlantic Challenge 2009 было частью программы третьего по счету кругосветного плавания «Крузенштерна», в которое судно отправилось 19 апреля 2009 г. из Калининграда.